本港新增543宗確診個案，包括211宗核酸檢測陽性，322宗快速測試陽性，89宗為輸入個案。第五波疫情累計有1,202,609宗個案。當局覆查上周五（6月3日）呈報的快測陽性個案，有75宗核酸檢測的結果為陰性或沒有提交樣本，佔整體25%。衞生防護中心傳染病處主任張竹君表示，當局現時會要求所有經快測平台呈報的陽性個案進行覆檢，若有人故意欺騙或呈報虛假訊息，當局將會採取法律行動。
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學校今日呈報204宗確診，涉及147間學校，至少數間學校有班別須停課，其中呈報12宗個案的九龍塘方方樂趣英文小學，小五F班有6人確診、小二F班有3人確診、小四H班有2人確診，小四F班有1人確診。部份染疫學童曾經於在6月3日下午3時至5時參加籃球班，當中6名學生有4人已確診，其餘2人須家居檢疫。另外，香港浸會大學附屬學校王錦輝中小學法文班再多3名密切接觸者染疫，深水埗福榮街官立小學小四C班有4名學生染疫，而寶血會上智英文書院爵士舞班群組則再多1人確診。
當局再發現多2宗懷疑Omicron BA.2.12.1個案，其中一名病人為中環威靈頓街Café Crêpe的員工，由於有太古城麥當勞群組患者曾於5月29日到訪該餐廳，當局懷疑他們之間有流行病學關連。至於餘下一宗個案，則為早前居於太古城高山台怡山閣患者的家人。
酒吧群組方面，蘭桂坊德己立街酒吧Shuffle新增16宗個案，累計錄85宗；LINQ則再多15宗確診個案，累計93宗。當局初步為73宗LINQ及Shuffle的個案進行全基因分析，結果顯示沒有出現L452Q變異，預料涉及本地流行病毒株。
過去24小時沒有病人離世，第五波累計死亡個案維持在9,172宗。公立醫院現時仍有367名確診病人留醫，多1人情況嚴重，15人康復出院。
